Obwohl Medulin nur 8 km von Pula entfernt liegt, besitzt es nicht so eine alte Geschichte und auch nicht so viele historische Bauwerke, wie andere Städte in Istrien.

Aus den archäologischen Funden in der Umgebung von Medulin schließt man, dass die Gegend bereits in der Antike besiedelt war. Das heutige Medulin befindet sich an der Stelle, an der die antike Stadt Mutila sich befand, die von den Römern im 2. Jahrhundert v. Chr. zerstört wurde. In Schriften aus dem 12. Jahrhundert wurde Medulin ebenfalls erwähnt, allerdings nur Zusammenhang mit Epidemien  und Zerstörungen. Auch in den folgenden Jahrhunderten war die Stadt nie von größerer Bedeutung.

Medulin blühte zwar im 17. Jahrhundert auf, als es zu Venedig gehörte, doch wurde die Stadt nie ein Ort von größerer Bedeutung.

Im 19. und 20. Jahrhundert begann die Gegend sich vor allem landwirtschaftlich zu entwickeln. Später war die Fischerei der wichtigste Wirtschaftszweig. Die eigentliche Erfolgsgeschichte von Medulin begann jedoch erst um 1960, als der Tourismus den historischen Ort entdeckte und er zu einer bekannten Sehenswürdigkeit wurde.

Heute ist der Tourismus fast die ausschließliche Einnahmequelle für die Menschen in dieser Region. Medulin verfügt über zahlreiche Hotels, mehrere Campingplätze und ein großes Angebot an privaten Unterkünften. Dass Medulin drüber hinaus über schöne und gepflegte Strände verfügt, hat den Ort zu einem er beliebtesten Reiseziele in Istrien gemacht.

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